Sendo uma Instituição centenária, a APISAL viveu diferentes momentos na sua História:

1891
Fundação, como Asilo, a 22 de março por Luís Pinto Moitinho

1892
Inauguração do Asilo, numa casa alugada do Largo do Conde Pombeiro, que pertencia ao Conde de Azarujinha, a 1 de Abril, com 13 educandas.

Mudança de instalações, para o no número 21 do Paço da Rainha, perante a necessidade de ampliação.

1893
Visita, a 8 de abril, de S. Majestade a Rainha D. Amélia, acompanhada pelo Príncipe Real D. Luiz Filippe, nomeado Presidente Honorário do Asilo que, considerando a sua importância vital na sociedade, o passou a visitar com frequência.

"Visitando hoje a casa em que se acha estabelecida a Associação Protectora da Infância Santo António de Lisboa, tive o ensejo de avaliar quanto é útil e moralizadora esta Instituição, congratulando-me por vêr meu filho, o Príncipe Real, presidir a uma obra que honra quem a empreendeu pelo bem que faz e prepara as crianças que a frequentam com princípios sãos e aptidões para o trabalho que nobilita."

Rainha D. Amélia

1895
Inauguração do actual edifício a 16 de junho.

1903
Ampliação do edifício no lado norte, com o acréscimo de camaratas, oficinas, vestiários, refeitório e capela para o culto a Santo António.

1904
Funcionamento em pleno, com cerca de 123 crianças, com as seguintes atividades: ourivesaria, estojos, modistas e floristas

1974/79
Cedência do espaço, por falta de educandas, à Instituição Cáritas Portuguesa para alojamento de retornados das Ex-Colónias.

1979
Reabertura da instituição, em novembro, por iniciativa de um grupo de residentes locais, como Jardim de Infância.

1980/81
Inauguração das respostas sociais e educativas Creche, CATL e 1º Ciclo do Ensino Básico.

2014
Início da projeção da reabilitação do edifício sede da APISAL (em desenvolvimento).

2016
Integração no Projeto Intesys (projeto-piloto com financiamento europeu que testou um modelo de Sistema integrado de Educação e Cuidados para a Infância).

Estabelecimento das seguintes parcerias: GABIP, Hospital D. Estefânia, Centro de Saúde, Largo Residências.

2018
Atribuição de Selo Escola Intercultural, pelo Ministério da Educação, ACM e Aga Khan.

Lançamento do livro da APISAL “Na minha escola cabe o mundo”, elaborado e ilustrado pelos alunos do 1º CEB.